在生活污水、食品加工和造紙等工業(yè)廢水中，含有碳水化合物、蛋白質(zhì)、油脂、木質(zhì)素等有機(jī)物質(zhì)。這些物質(zhì)可通過水中微生物的生物化學(xué)作用而分解，水中溶解氧耗盡后，有機(jī)物進(jìn)行厭氧分解，產(chǎn)生硫化氫、氨和硫醇等難聞氣味，使水質(zhì)進(jìn)一步惡化。

植物營(yíng)養(yǎng)物主要指氮、磷等能刺激藻類及水草生長(zhǎng)、干擾水質(zhì)凈化，使BOD5升高的物質(zhì)。水體中營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)過量所造成的“富營(yíng)養(yǎng)化”對(duì)于湖泊及流動(dòng)緩慢的水體所造成的危害已成為水源保護(hù)的嚴(yán)重問題。

有毒污染物指的是進(jìn)入生物體后累積到一定數(shù)量能使體液和組織發(fā)生生化和生理功能的變化，引起暫時(shí)或持久的病理狀態(tài)，甚至危及生命的物質(zhì)；如重金屬和難分解的有機(jī)污染物等。

石油進(jìn)入水體后的危害是多方面的，如在水上形成油膜，能阻礙水體復(fù)氧作用；油類粘附在魚鰓上，可使魚窒息；粘附在藻類、浮游生物上，可使它們死亡；油類會(huì)抑制水鳥產(chǎn)卵和孵化，嚴(yán)重時(shí)使鳥類大量死亡；石油污染還能使水產(chǎn)品質(zhì)量降低。

放射性污染物主要來源于核動(dòng)力工廠排出的冷卻水，向海洋投棄的放射性廢物，核爆炸降落到水體的散落物，核動(dòng)力船舶事故泄漏的核燃料；開采、提煉和使用放射性物質(zhì)時(shí)，如果處理不當(dāng)，也會(huì)造成放射性污染。

熱污染是一種能量污染，它是工礦企業(yè)向水體排放高溫廢水造成的。一些熱電廠及各種工業(yè)過程中的冷卻水，若不采取措施，直接排放到水體中，水中化學(xué)反應(yīng)使某些有毒物質(zhì)的毒性提高，影響魚類的生存和繁殖，加速某些細(xì)菌的繁殖。

各種酸、堿、鹽（鹽污染主要來自生活污水和工礦廢水以及某些工業(yè)廢渣）等無機(jī)物進(jìn)入水體，使淡水資源的礦化度提高，影響各種用水水質(zhì)。水體中無機(jī)鹽增加能提高水的滲透壓，對(duì)淡水生物、植物生長(zhǎng)產(chǎn)生不良影響。

工廠在生產(chǎn)過程中，污水不加處理直接排放到河流，污染自然水域。工業(yè)廢水是水體污染的主要來源，它具有廣泛的范圍，大量的被污染的物質(zhì)和復(fù)雜的成分。

由于耕作或開荒使土地表面疏松，降雨時(shí)大量泥沙流入水中，增加了水中的懸浮物。在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)過程中，農(nóng)藥、化肥的使用量日益增多，通過降雨，一些有害物質(zhì)會(huì)滲入地表水，形成水污染。

由于城市人口集中，城市生活污水、垃圾和廢氣引起水體污染。人們?nèi)粘Ｉ钪挟a(chǎn)生的各種污水的混合液（包括廚房、廁所等排出的污水）流到河流或地下，造成水污染。