“碧云凈院原名三王廟”位于浦東張江鎮(zhèn)環(huán)東村三灶鎮(zhèn)的萬(wàn)安橋東首，是浦東地區(qū)迄今所存的最古老佛教道場(chǎng)。此地域在唐天寶十年起屬“松江府”華亭縣，元代至元年設(shè)上?？h，歸上?？h，清雍正四年（1726年）設(shè)南匯縣，該地域行政區(qū)劃為“南匯縣長(zhǎng)人鄉(xiāng)十七保十二圖”。據(jù)清代南匯縣志記載：“該廟為元代至正年間（1341-1367年）推官（元、明時(shí)典獄官名）‘臨淄郡侯’陳明之妻奚氏所建之家廟，別有一王廟、二王廟在西南匯縣境，均未詳所祀何神”。在元代“至正年”時(shí)與附近的“普凈禪院”（即大圣寺）共有僧尼近二十人，終日香火不斷，鄉(xiāng)里信佛民眾甚廣，每逢農(nóng)歷節(jié)日，四鄉(xiāng)八里前往進(jìn)香的善男信女絡(luò)繹不絕，成為一方名剎。

延至二百多年后的明代嘉靖33年（1554年），倭寇侵?jǐn)_江浙沿海，“碧云凈院”毀于兵火。幸有善人蔡士安的努力，保存了佛像、修繕?lè)鸬?、又筑一楹以供“觀音大士”像。碧云凈院雖得以飭整，但難與昔日相比。明萬(wàn)歷二十七年（1599年），道人康性敏渡海朝覲普陀山觀音大士后，感慨不忍碧云凈院之蕭索冷落，遂與士人張?jiān)?、張延憲、奚君、蔡士安之孫等集議重修碧云凈院。在眾信徒的資助下，在“性敏”的一手操持下，費(fèi)盡心機(jī)、歷盡萬(wàn)難，經(jīng)二年辛苦努力，于萬(wàn)歷二十九年（1601年）終于落成。重修后的碧云凈院共有三殿，“金碧輝煌、玄關(guān)肇啟、梵音朗朗、達(dá)于丙夜?！笨梢?jiàn)當(dāng)廟宇的壯觀、佛事勤從、信眾至誠(chéng)、香火旺盛。

又經(jīng)二百多年后的清代同治年間，太平天國(guó)“東征軍”進(jìn)軍浦東，由于太平軍宗教信仰上的敵視，“碧云凈院”復(fù)遭劫難，毀壞夷遺。清光緒二十五年（1899年），里人顧榮蕊與“住持”重修廟之東半埭，顧泰山與郭文彪合資建造西廂。信眾們又捐助耕田二十四畝作“廟田”，以供僧尼之“耕食”。碧云凈院得以延續(xù)。

解放后的1951年，政府為發(fā)展教育事業(yè)，借廟興學(xué)，在碧云凈院內(nèi)辦起了“三灶小學(xué)”。1958年“大躍進(jìn)”年代，尼姑還俗，宗教活動(dòng)基本停止。1966年在文化大革命“破四舊”的熱潮中，佛像全數(shù)被搗毀，廟產(chǎn)歸學(xué)校所有，“碧云凈院”不復(fù)存。到了粉碎“四人幫”以后的年代，可嘆“碧云凈院”，這六百多年的佛教文化古跡，只存下一棟破舊的后殿，還有那四只“石礎(chǔ)”與一塊殘碑，淹沒(méi)在荒草之中。

1999年，浦東新區(qū)宗教辦落實(shí)宗教政策，開(kāi)放碧云凈院作為宗教活動(dòng)場(chǎng)所，并委派原上海慈修庵知客克蓮法師主持碧云凈院的修復(fù)和日常工作。雖然旅美僑胞顧雪英女士捐助建造了“雪英小學(xué)”后，“三灶小學(xué)”得以遷出，但面對(duì)如此殘存破陋不堪的廟舍，一無(wú)資金，二是人生地不熟，加上執(zhí)迷之人的作難與毀謗，重修碧云凈院困難重重?？松彿◣煵晃菲D難，本著“莊嚴(yán)國(guó)土、利樂(lè)有情、法輪常轉(zhuǎn)、正法久住”的宗旨，白手起家，為“修殿安僧”四處奔波。她尊承“佛教法儀”進(jìn)行宗教活動(dòng)，深得八方“正信佛教”信眾的擁護(hù)支持。當(dāng)?shù)氐膶?shí)業(yè)家瞿建國(guó)先生為搶救這六百多年的佛教文化古跡，不但他與他的“建國(guó)慈善基金會(huì)”樂(lè)助二十余萬(wàn)元人民幣，還“勸募”其好友仰融先生樂(lè)助人民幣二百萬(wàn)元。顧雪英女士也樂(lè)助五萬(wàn)元人民幣。在“八方信眾”的樂(lè)助下，開(kāi)始了修復(fù)碧云凈院古寺的工程。2001年12月23日，碧云凈院主體建筑“大雄寶殿”落成，兩側(cè)二層廂房也相繼完工了一層。（西廂是原新康村“仁壽庵”俗稱“徐家廟”的動(dòng)遷款建造，內(nèi)供“仁壽庵”移來(lái)的佛像）。2004年底，山門(mén)及天王殿在周金存先生墊資建造下落成，2005年兩側(cè)廂房的第二層建筑也告完工。所有佛像，從2001年起至2005年陸續(xù)請(qǐng)裝完善。并于同年12月26日莊嚴(yán)而隆重的舉行了殿堂落成暨全堂佛像開(kāi)光大典。

重修的碧云凈院，香煙繚繞，香客往來(lái)不絕，晨鐘暮鼓，巍巍壯觀，彰顯佛法莊嚴(yán)，每當(dāng)周末還有大批的居士來(lái)院共修。這浦東地區(qū)最古老的佛教文化遺跡，如“鳳凰涅盤(pán)”，重現(xiàn)新的活力。此乃是克蓮法師與廣大信眾的無(wú)量功德。碧云凈院雖然建在郊區(qū)出家人的生活很清貧，但是克蓮法師常常教誨弟子：“雖度日有難兮，然修道之心不可息也，修道因財(cái)乎？為蒼生也！”。